اهداف و برنامه‌ها و چشم انداز کتابخانه دانشکده علوم پزشکی مراغه شامل موارد زیر می‌باشد:
۱- بررسي و ارزيابي وضعيت موجود كتابخانه‌ها و خدمات كتابخانه‌ای از نظر كمی و كيفی و اجرای طرحهای تحقيقاتی مرتبط، به منظور شناسايی نقاط ضعف موجود در كتابخانه‌های دانشگاه و مراكز درمانی
۲- ارتفاء كمی و كيفی خدمات كتابخانه‌ای و اطلاع رسانی پزشكي در كتابخانه‌های مراكز درمانی- آموزشی تابعه دانشگاه
۳- آموزش وتوانمندسازی نيروی انسانی كتابدار (كتابداران دانشگاه) با هدف تخصصي نمودن بخش‌های كتابخانه و بهينه‌سازی كيفيت ارائه خدمات كتابخانه‌ای دانشگاه
۴- اصلاح و بهينه‌سازی مجموعه عناوين مجلات چاپی لاتين
۵- نصب نسخه‌های جدید نرم افزار جامع كتابخانه و ويرايش آن به منظور استانداردسازی خدمات کتابخانه‌ای
۶- وجين دوره‌ای و بروز نمودن كتابهای موجود در کتابخانهﻫﺎی دانشگاه
۷- برگزاری کارگاه‌های آموزشی به منظور استفاده بهینه  اعضاء محترم هيئت علمی، دستياران و دانشجويان از منابع اطلاعاتی موجود در کتابخانه دیجیتال
۸-مشاوره اطلاعاتی کتابداران دانشکده  اعم از اطلاعات کتاب شناختی  منابع چاپی و مشاوره منابع  دیجیتال
۹- گسترش ارتباط بین دانشگاهی به منظور تامین منابع مورد نیاز کاربران از طریق خدمات امانت بین کتابخانه‌ای
۱۰- گسترش کمی و کیفی پايگاه‌های الکترونیکی جديد در حوزه‌های پزشكی و پیراپزشکی

که تقریبا همه برنامه‌ها به صورت عملی در این کتابخانه اجرا می‌گردد.